ניצחון המכבים היה נר לרגליהם של מפקדים רבים בזרוע הים. תעוזתם וגבורתם של המכבים היוו מקור השראה למבצעים רבים ומוצלחים בהיסטוריה של הזרוע
סיפור ניצחון המכבים היה נר לרגליהם של מצביאים, מפקדים וחיילים רבים במהלך ההיסטוריה. הסיפור מדגיש את חשיבות האמונה בצדקת הדרך ומסירות הנפש של הלוחמים, אשר בזכותם הושג הניצחון. במובנים רבים זרוע הים היא המקבילה המודרנית לצבא המכבים. אף על פי שלזרוע מימדים צנועים ביחס לציים זרים, במהלך השנים לוחמיה לקחו חלק באין ספור מבצעים נועזים שהפכו את הזרוע לכוח מרכזי במזרח התיכון. לכבוד נר רביעי של חנוכה חזרנו אחורה לארבעה מבצעים היסטוריים של זרוע הים שהוכיחו פעם אחר פעם שזאת לא הכמות, זאת האיכות.
מילוט נועז בערב חג המולד- "מבצע נועה", דצמבר 1969:
בסוף שנות ה-60 הוחלט על הקמת שייטת ספינות טילים, כלי שיט קלים ומהירים שיכולים לשאת מערכות נשק מתקדמות ולהחליף את המשחתות והטרפדות הישנות. נקבע כי בניית הסטי"לים החדשים תתבצע בעיר שרבורג בצרפת. בעקבות התרחבות האמברגו הצרפתי ב-1968 נוצר מצב בו חלק מהספינות שהוזמנו הוחזקו בצרפת והיה צורך למלטם לישראל. במחצית השנייה של 1969 החל תכנון מילוט הספינות. כדי להטעות את הצרפתים הוקמה בפנמה חברה בשם "סטארבוט" שביקשה לרכוש את הספינות לחיפוש נפט. הצרפתים אישרו את העסקה והישראלים החלו בהכנות למילוט שכללו הטסת אנשי צוות לצרפת ורכישת מזון וציוד תחת מעטה של חשאיות. ספינות הטילים חמקו באישון לילה לים בין ה-24 ל-25 בדצמבר בשעה 02:30 לפנות בוקר, בזמן שתושבי העיר שרבורג היו עסוקים בחגיגות חג המולד. הן הגיעו ארצה בשלום ב-31 בדצמבר 1969 לאחר הפלגה של 7 ימים. הצלחת המבצע עוררה גל של אהדה כלפי מדינת ישראל והערצה כלפי תושייתם של מתכנני המבצע ואנשי זרוע הים.
קרב טילי ים-ים הראשון בעולם- 'קרב לטקיה', 6 באוקטובר 1973:
'קרב לטקיה' הוא אחד הקרבות המוכרים בתולדות זרוע הים הישראלית. הקרב, שהתרחש במלחמת יום הכיפורים, היה קרב טילי ים-ים הראשון בעולם. הוא התרחש בלילה שבין ה-6 ל-7 באוקטובר 1973. במהלך הקרב הצליחה שייטת 3, בעזרת טילי 'גבריאל' שפותחו בארץ, להטביע חמישה כלי שיט סוריים, בעוד שכל כוחותינו שבו בשלום. הצלחתה של שייטת 3 בקרב מול חיל הים הסורי הוכיחה את עליונותה ויעילותה של תורת הלחימה שפותחה בזרוע במשך השנים.
חיסול ממוקד- מבצע דרך הנץ, 4 באפריל 1985:
בשנת 1985 זיהו גופי המודיעין הישראלי כוונה של ארגון אש"ף לבצע פיגוע טרור בישראל ביום הזיכרון לחללי מערכות ישראל. התברר כי הארגון רכש 2 אוניות משא, "מון לייט" ו"אטווירוס", שעליהן הייתה עתידה להפליג ביום הזיכרון חוליית המחבלים לישראל כנוסעים סמויים. המחבלים תכננו להתחבא באחת מהמכולות ועם הגעתם ארצה להשתלט על אוטובוס מלא בנוסעים, שבאמצעותו יחדרו למחנה רבין (בסיס הקריה) על מנת לנהל משא ומתן לשחרור מחבלים הכלואים בארץ. האוניות שיועדו לפיגוע עגנו בנמל 'ענאבה' באלג'יריה. הוחלט כי יחידת הקומנדו הימי תשמיד את האוניות ולמבצע יצאו ארבע ספינות טילים ישראליות שעל סיפונן לוחמי הקומנדו הימי. ההפלגה לאלג'יריה נמשכה שבועיים והייתה בתנאי מזג אוויר קשים. עם הגעתם לאזור יצאו לוחמי הקומנדו בשעת לילה מאוחרת בצלילה חשאית אל עבר האוניות, הם זיהו את ה"מון לייט" והצמידו מטען חבלה לדופן האוניה. לאחר מספר דקות, במהלכן התרחקו הלוחמים מהאזור, נשמע הפיצוץ שהטביע את הספינה.
מבצע מתח גבוה- 17 באפריל 1980:
ב-7 באפריל 1980 יצאו חוליית מחבלים פלסטינים מלבנון וביצעו פיגוע בקיבוץ משגב-עם. המחבלים יצאו מבסיס בראס-א-שק בלבנון ועל פי מידע מודיעיני עמד לצאת מבסיס זה פיגוע נוסף. לאור המתיחות הגוברת בארץ הוחלט כי יש להשמיד את בסיס המחבלים. לצורך המשימה נבחרה יחידת הקומנדו הימי של זרוע הים. וב-17 באפריל יצאו לוחמי הקומנדו הימי יחד עם לוחמי שייטת ספינות הטילים למבצע 'מתח גבוה'. המים בקרבת הבסיס בלבנון היו רדודים לכן לוחמי הקומנדו היו צריכים להגיע אליו בשחייה. תוך כדי, הסטי"לים שחיכו בים פתחו בירי ליעד אחר לצורך הסחה, לוחמי הקומנדו פתחו במכת אש חזקה על המתחם ומיד לאחר מכן הסתערו על המבנים וחיסלו אותם בקרבות פנים אל פנים. בתום הלחימה, לוחמי הקומנדו הימי הרסו את הבסיס עם מטעני נפץ. בפשיטה נהרגו 20 מחבלים.